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同裂酶和同尾酶點擊次數:5721 更新時間:2015-08-03

同裂酶

同裂酶,國內外比較一致的定義,是來源于不同物種但能識別相同DNA序列的限制性內切酶,切割位點可以相同也可以不同。不過國內和國外在同裂酶的定 義及其定名上,隨不同的人有許多差異。國內外還有另一種定義,稱同裂酶是來源于不同物種但能識別相同DNA序列且切割方式相同的酶。經網上檢索,這兩種定 義出現的比例均較大,均具有一定的代表性。

經檢索國外和國內資料,同裂酶的英文以isoschizomer的出現占絕大多數,只有極少數國內資料將其表示為isocaudomer(與國內文 獻出現的同尾酶相混淆),一致表明同裂酶的英文名應為isoschizomer。但是,對于第二種酶即所謂的異功酶,國外有一個一致的名稱,叫做 neoschizomer。

關于同裂酶,國外的主要限制酶生產公司如MBI Fermentas、NEB New England Biolabs、Roche、Promega、Amersham Biosciences等均有其介紹,且多數列出了各個酶的同裂酶。

同裂酶在基因工程的DNA重組中有重要的應用,尤其是在載體構建方面往往可以取得巧妙的應用。代表性、應用較多、較為熟悉的同裂酶比如Sma1和Xma1,它們均識別CCCGGG,但前者切后產生鈍末端,后者切后產生粘性末端。

一般人主要不太熟悉各個酶的同裂酶到底都是些什么。不過查同裂酶還算方便,前面提到的各個主要限制酶生產公司的網頁上均有相應的清單。

通過對Highwire、Elsevier ScienceDirect、SpringerLink、Blackwell、 IngentaConnect、Oxford University Press、John Wiley and Sons、 NCBI Pubmed Central、EBSCOhost等專業文獻數據庫檢索,有關同裂酶的研究文獻還不算很少,但絕大多數是關于從一個物種中發現 某個酶的同裂酶的報道,基本上沒有發現有關同裂酶的綜述性文獻和規律性研究文獻,文獻中也很難找到全面性的同裂酶的清單或列表。所以要查找實用性的同裂 酶,是直接查找上述限制酶生產公司的資料。

同尾酶

同尾酶,即能切割產生相同末端的限制性內切酶,一般是指能產生相同粘性末端的限制酶。所有鈍末端酶產生的末端均是相同的,但一般不把它作為同尾酶來 研究。故名思義,同尾酶是不同的酶,它們只是切割DNA產生的末端相同,同尾酶之間的識別序列可以相同也可以不同,但基因工程中識別序列不同的同尾酶的應 用性zui大。

關于同尾酶的英文名稱很值得大家研究。

在GOOGLE中搜索“同尾酶",可以從一些中文資料中得到其英文名,但至少有4個:isocaudamer、isocaudarner出現較 多,isocaudiner、isocaudomer出現極少,說明應以前兩個之一為主。問題是,國內不同的學者在課件和論文中對前兩個的用法不一致,究 竟用哪一個不好定,這其中還有后面講到的原因。

采用這4個詞從GOOGLE上搜索同尾酶不同的英文名詞出現的頻率,前兩者出現的比后兩者多。但是極需注意的是,出現的網頁幾乎是中文網頁或中國人的英文網頁,也就是說地道的英文網頁上很難出現這4個關于同尾酶的名詞!

更值得注意的是,將這4個同尾酶的英文名詞逐一在主要專業文獻數據庫(見上樓)的文章名、關鍵詞和摘要中進行檢索,除EBSCO外竟沒有一篇文章出來!EBSCO上的這2篇文章也是中國人的中文文章,文章是:

1、 [Construction, expression and purification of repeat fragment polymer of oInhibin alpha- subunit N terminal 1-33 fragment] (chi; includes abstract) By Huang YM, Sheng Wu Gong Cheng Xue Bao, 2005 Mar; Vol. 21 (2), pp. 311-4; PMID: 16013496 (是 用isocaudamer在摘要中檢索出來)

2、 [The structural characteristics, alternative splicing and genetic experession analysis of ADP- ribosylation- factor 1 (arf1) in cotton] (chi; includes abstract) By Ren MZ, Yi Chuan Xue Bao, 2004 Aug; Vol. 31 ( pp. 850-7; PMID: 15481542(是 用isocaudarner在摘要中檢索出來)

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